RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-202ENST00000517979 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 SLC22A12Q96S37 553 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 CHRDQ9H2X0 955 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 KRT82Q9NSB4 513 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ABL1P00519 1130 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC130P13994 396 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 HDCP19113 662 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 GTF2H1P32780 548 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 MXI1P50539 228 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 USP4Q13107 963 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 MTAPQ13126 283 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 LRRC32Q14392 662 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 MTF1Q14872 753 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PON2Q15165 354 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 SPATA20Q8TB22 786 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 RIN3Q8TB24 985 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 IER2Q9BTL4 223 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 EBF3Q9H4W6 596 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 GCNT4Q9P109 453 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 FAM186AA6NE01 2351 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 STX10O60499 249 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 AP1G2O75843 785 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 CHRNB1P11230 501 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ARSAP15289 507 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PFKLP17858 780 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 YWHAQP27348 245 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PPP3CCP48454 512 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TAF10Q12962 218 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 STIM1Q13586 685 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 RUNX3Q13761 415 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PDGFRLQ15198 375 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF77Q15935 545 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 KRT39Q6A163 491 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 UNC93AQ86WB7 457 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 FUKQ8N0W3 1084 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 NUP93Q8N1F7 819 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 FBXO32Q969P5 355 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 KCNK16Q96T55 309 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 HPS4Q9NQG7 708 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PSMA7O14818 248 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 CD58P19256 250 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 IFNAR2P48551 515 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 SLC5A3P53794 718 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 LRRC63Q05C16 580 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 INCA1Q0VD86 236 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PPP2R5DQ14738 602 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ISM2Q6H9L7 571 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 TSSK4Q6SA08 328 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 ADSSL1Q8N142 457 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 CPA6Q8N4T0 437 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 C12orf29Q8N999 325 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC25-202ENST00000517979 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms