RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 SYT12Q8IV01 421 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 C3orf20Q8ND61 904 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CEP72Q9P209 647 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1B0GUL6 1792 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 DRGXA6NNA5 263 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 AP1G1O43747 822 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 FAM151AQ8WW52 585 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 OPTNQ96CV9 577 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ERO1AQ96HE7 468 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MEIS3Q99687 375 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 SIL1Q9H173 461 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 GNAI2P04899 355 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MALP21145 153 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CHN2P52757 468 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 HK3P52790 923 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 NHLH2Q02577 135 aa7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1B0GUL7 405 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CETPP11597 493 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM27P14373 513 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 PRDX5P30044 214 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 IL12RB1P42701 662 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 PHKA1P46020 1223 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MAP2K6P52564 334 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 SP3Q02447 781 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 PPIL2Q13356 520 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 SNAPC2Q13487 334 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 LCE1DQ5T752 114 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 METRNLQ641Q3 311 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 SPRED1Q7Z699 444 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-225ENST00000515835 FAM167AQ96KS9 214 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 LRGUKQ96M69 825 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 IDI2Q9BXS1 227 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 GAKO14976 1311 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SMARCA1P28370 1054 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CACNB3P54284 484 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TIMM10P62072 90 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FOXE3Q13461 319 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 MLC1Q15049 377 aa7.27□□□□□ -1.25
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