RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483465.5

IFT80-220, Transcript of intraflagellar transport 80, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IFT80, Length 4,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT80-220ENST00000483465 XKRXQ6PP77 449 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ZNF600Q6ZNG1 722 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 RTKN2Q8IZC4 609 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 LILRB2Q8N423 598 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 KIAA1958Q8N8K9 716 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 HERVK_113Q902F9 699 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 SGK3Q96BR1 496 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 MS4A14Q96JA4 679 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ZNF347Q96SE7 839 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 IER2Q9BTL4 223 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 APOL5Q9BWW9 433 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 VPS33BQ9H267 617 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 OR51B5Q9H339 312 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 FLT1P17948 1338 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 OR5K3A6NET4 321 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 OR5K4A6NMS3 321 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 H3BSA7 217 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ARHGEF9O43307 516 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 KLHL41O60662 606 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 RHOBTB3O94955 611 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 IL1BP01584 269 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 FDPSP14324 419 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 PSMC3P17980 439 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 GSTM2P28161 218 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 IL12AP29459 219 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 STAT1P42224 750 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 NAMPTP43490 491 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 VBP1P61758 197 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 CDK16Q00536 496 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 CDC20Q12834 499 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 KCTD2Q14681 263 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 TRIP10Q15642 601 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 DUSP7Q16829 419 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 GRAMD1BQ3KR37 738 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 MTERF2Q49AM1 385 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 KRT40Q6A162 431 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 FAM171BQ6P995 826 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 GPR180Q86V85 440 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 STX12Q86Y82 276 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 VPS33AQ96AX1 596 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 FAR2Q96K12 515 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 B3GALT6Q96L58 329 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 PSMB7Q99436 277 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 PNPLA3Q9NST1 481 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 TAS2R7Q9NYW3 318 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 AMFRQ9UKV5 643 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 POLIQ9UNA4 740 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 UBE4BO95155 1302 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ENPP3O14638 875 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 DYRK3O43781 588 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 UGT1A9O60656 530 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 SPAG6O75602 509 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 CBX6O95503 412 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 GSNP06396 782 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 GSTM1P09488 218 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 THRAP10827 490 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 ZNF3P17036 446 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 UGT1A6P19224 532 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 UGT1A1P22309 533 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 UGT1A4P22310 534 aa4.05□□□□□ -1.76
IFT80-220ENST00000483465 UGT1A3P35503 534 aa4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms