RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CXCR5P32302 372 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PPM1AP35813 382 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GRIK1P39086 918 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ACADSBP45954 432 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KRT17Q04695 432 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TCEAL1Q15170 157 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PSMD5Q16401 504 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMEM110Q86TL2 294 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VPS52Q8N1B4 723 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EMC1Q8N766 993 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HSFY1Q96LI6 401 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM117AQ9C073 453 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AMFRQ9UKV5 643 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ALG6Q9Y672 507 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.75□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CARNS1A5YM72 827 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADAM12O43184 909 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SRGAP2O75044 1071 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EFEMP2O95967 443 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 URODP06132 367 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MYOGP15173 224 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR1D2P34982 312 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GLUD2P49448 558 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NDUFV1P49821 464 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TKTL1P51854 596 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC6A3Q01959 620 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TAP1Q03518 808 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPS6KA1Q15418 735 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SHHQ15465 462 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TAF5Q15542 800 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TLR10Q9BXR5 811 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHST7Q9NS84 486 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 USTQ9Y2C2 406 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDH23Q9H251 3354 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KCNK3O14649 394 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TBC1D4O60343 1298 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PROSCO94903 275 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LINC00271P0C7V0 271 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDGFRAP16234 1089 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PSMA2P25787 234 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CTNNB1P35222 781 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OGDHQ02218 1023 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DSG1Q02413 1049 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADCY1Q08828 1119 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GPR17Q13304 367 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DDR2Q16832 855 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 STKLD1Q8NE28 680 aa6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms