RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 KREMEN1Q96MU8 473 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 SCINQ9Y6U3 715 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 E9PBE3 544 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 KLHL41O60662 606 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 CSPG5O95196 566 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PSMC3P17980 439 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 STIP1P31948 543 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 EMP3P54852 163 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 NR1H2P55055 460 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 RPS8P62241 208 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 FLOT2Q14254 428 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 DDHD1Q8NEL9 900 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 SLCO2A1Q92959 643 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 WRNIP1Q96S55 665 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 DRC3Q9H069 523 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PLGRKTQ9HBL7 147 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 CLUHO75153 1309 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 KIF1AQ12756 1690 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 DYTNA2CJ06 578 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ERVV-1B6SEH8 477 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 C6orf229H3BNL8 230 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ALOX15BO15296 676 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 KCNQ2O43526 872 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 KDM1AO60341 852 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 AVILO75366 819 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 TCF4P15884 667 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ELK3P41970 407 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 NUDT2P50583 147 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ESRRGP62508 458 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 MORF4L2Q15014 288 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 FAXCQ5TGI0 409 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 C16orf46Q6P387 395 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 AAGABQ6PD74 315 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 XKR5Q6UX68 686 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 TDRPQ86YL5 185 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 RIOX1Q9H6W3 641 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PLA2G4CQ9UP65 541 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 KBTBD13C9JR72 458 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 F5H423 210 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 J3QRK9 145 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 NEMP1O14524 444 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 LIASO43766 372 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 DNAJA2O60884 412 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 KCNA4P22459 653 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 SERPINB5P36952 375 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 HADHBP55084 474 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 GSTM4Q03013 218 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 RELAQ04206 551 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PARP10Q53GL7 1025 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ASPRV1Q53RT3 343 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 EFHC2Q5JST6 749 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 KCNT1Q5JUK3 1230 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 PACS1Q6VY07 963 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF410Q86VK4 478 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 FBXL8Q96CD0 374 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 HAUS8Q9BT25 410 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN1-201ENST00000295522 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 ZBTB5O15062 677 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 MCF2LO15068 1137 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 MAP3K6O95382 1288 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 PCYT1AP49585 367 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 MYBPC1Q00872 1141 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 FAM182BQ5T319 152 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 POTEHQ6S545 545 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 DDI1Q8WTU0 396 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 NLRP7Q8WX94 980 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 SLC35B4Q969S0 331 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 FAM86B1E9PN63 330 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 F5H6K3 240 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 KRT37O76014 449 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 FAM86B2P0C5J1 330 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 KLRC2P26717 231 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 C21orf59P57076 290 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 SLC15A3Q8IY34 581 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN1-201ENST00000295522 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms