RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592170.5

SEH1L-209, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00271P0C7V0 271 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GZMAP12544 262 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ADORA2BP29275 332 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PPM1AP35813 382 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 RABGGTBP53611 331 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SKOR1P84550 965 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PRR20EP86478 221 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PRR20CP86479 221 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PRR20DP86480 221 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PRR20BP86481 221 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PRR20AP86496 221 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TSPY1Q01534 308 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CENPCQ03188 943 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 RTP2Q5QGT7 225 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF280DQ6N043 979 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM35BQ8NCS4 154 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TIFAQ96CG3 184 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM209Q96SK2 561 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TTPALQ9BTX7 342 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ISCUQ9H1K1 167 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 LHX5Q9H2C1 402 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF576Q9H609 170 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TFR2Q9UP52 801 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CEP83Q9Y592 693 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.13□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ESPNB1AK53 854 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SOD2P04179 222 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 H2AFZP0C0S5 128 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CTHP32929 405 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GALCP54803 685 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 USP41Q3LFD5 358 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PKDCCQ504Y2 493 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 FAM171BQ6P995 826 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 H2AFVQ71UI9 128 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TTC30AQ86WT1 665 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 FUKQ8N0W3 1084 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 UBA3Q8TBC4 463 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CPA5Q8WXQ8 436 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MYLPFQ96A32 169 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PKMYT1Q99640 499 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MED10Q9BTT4 135 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 HESX1Q9UBX0 185 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PATJQ8NI35 1801 aa11.12□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 LINC01553A4QN01 128 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ANKRD62A6NC57 917 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 OR6C75A6NL08 312 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 H7C4K7 107 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CLDN5O00501 218 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PJA2O43164 708 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 FGF18O76093 207 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 OR4Q2P0C623 313 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MYOGP15173 224 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ABCB4P21439 1286 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CTNNB1P35222 781 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ARHGAP25P42331 645 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 GPD2P43304 727 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 BCAT1P54687 386 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PLCB3Q01970 1234 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 KIF5AQ12840 1032 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PAQR9Q6ZVX9 377 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 MON1BQ7L1V2 547 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 FAM35AQ86V20 835 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.11□□□□□ -0.63
SEH1L-209ENST00000592170 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms