RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 MATN2O00339 956 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TBX3O15119 743 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 NCK2O43639 380 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 NOBOXO60393 691 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TLR2O60603 784 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 IL18RAPO95256 599 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 GNAI3P08754 354 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 RAP2AP10114 183 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ABCB4P21439 1286 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PCSK1P29120 753 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PPM1AP35813 382 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 KCNJ5P48544 419 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MAPK10P53779 464 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 GNAI1P63096 354 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TNFAIP2Q03169 654 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DAG1Q14118 895 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DLK2Q6UY11 383 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 RAET1EQ8TD07 263 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 RABGGTAQ92696 567 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1191Q96A73 305 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 SCLT1Q96NL6 688 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CEP83Q9Y592 693 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 F2RL2O00254 374 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 B4GALT3O60512 393 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 FPR1P21462 350 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CASRP41180 1078 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PIK3CGP48736 1102 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PTH1RQ03431 593 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DACT2Q5SW24 774 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MOB2Q70IA6 237 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 SESTD1Q86VW0 696 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CPXCR1Q8N123 301 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB123Q8N688 67 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PRO3102Q9H379 93 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 CDC23Q9UJX2 597 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 SH3BP5O60239 455 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 NUAK1O60285 661 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 PRKG1Q13976 671 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DCTN1Q14203 1278 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CCT6BQ92526 530 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM63Q969Q1 353 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 EVI5LQ96CN4 794 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 NR2E1Q9Y466 385 aa6.34□□□□□ -1.39
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