RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB27B	O00194	218 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ASNA1	O43681	348 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TOM1	O60784	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS23	O95084	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CKB	P12277	381 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CKMT1A	P12532	417 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ALAS1	P13196	640 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ACVR2A	P27037	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	EID2B	Q96D98	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX27	Q96L92	541 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TISP43	B9A030	160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308		B9A039	149 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308		H7C4K7	107 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308		J3KRW8	73 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO1C	O00159	1063 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	IRAK2	O43187	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ADH4	P08319	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TGM1	P22735	817 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MXRA7	P84157	204 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	GRM7	Q14831	915 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	NPY5R	Q15761	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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