RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TNIP3Q96KP6 325 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf48Q96LL4 319 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL2Q9BWV7 592 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CLSTN2Q9H4D0 955 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM86C1Q9NVL1 165 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1468Q9P260 1216 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CILPO75339 1184 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TARSP26639 723 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ADORA2BP29275 332 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC40Q4G0X9 1142 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC8Q8TAM2 541 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TATDN2Q93075 761 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCD1Q96GM5 515 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP63Q96MT8 703 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 MED15Q96RN5 788 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SMOQ99835 787 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNH6Q9H252 994 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 LTB4R2Q9NPC1 389 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB20Q9NX57 234 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG2BQ96BY7 2078 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 KANSL1LA0AUZ9 987 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 DPYSL4O14531 572 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF263O14978 683 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 AP1G2O75843 785 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 WEE1P30291 646 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 AVPR1AP37288 418 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R2P41236 205 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKCQQ04759 706 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TNK2Q07912 1038 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 UBXN2BQ14CS0 331 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF394Q53GI3 561 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC17AQ6ZS10 378 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 MON1AQ86VX9 555 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC93AQ86WB7 457 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 BPIFB1Q8TDL5 484 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 IRF7Q92985 503 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM122AQ96E09 287 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2S1Q96SQ9 504 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 LMBRD1Q9NUN5 540 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 GCNT4Q9P109 453 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 PIAS3Q9Y6X2 628 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 USP34Q70CQ2 3546 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP8B3O60423 1300 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 H0Y858 1186 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CHADO15335 359 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 STX10O60499 249 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 FMO5P49326 533 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC5A3P53794 718 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 USP4Q13107 963 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 FRMD5Q7Z6J6 570 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 YAF2Q8IY57 180 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYBG2Q8N1P7 616 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIML1Q8N9V2 468 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAMP5Q8TAC9 235 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 JAKMIP2Q96AA8 810 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 E2F7Q96AV8 911 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP3A43Q9HB55 503 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 OBP2AQ9NY56 170 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 GTSE1Q9NYZ3 720 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 COQ4Q9Y3A0 265 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 BICDL2A1A5D9 508 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF10BO14763 440 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CKMP06732 381 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPN5P54829 565 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ZXDBP98169 803 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 LRMPQ12912 555 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF10Q12962 218 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF77Q15935 545 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR44Q5JSH3 913 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC20AQ6ZU45 233 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF687Q8N1G0 1237 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 DTWD2Q8NBA8 298 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC16Q8NEE8 873 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SHDQ96IW2 340 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 NT5C1AQ9BXI3 368 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CISHQ9NSE2 258 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TDP1Q9NUW8 608 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SIT1Q9Y3P8 196 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF840PA6NDX5 716 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 PGFP49763 221 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K7CLP57077 242 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 DPCR1Q3MIW9 517 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXR2Q6PJQ5 311 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNDC11Q6PKC3 985 aa19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms