RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FATE1Q969F0 183 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FUT8Q9BYC5 575 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PARP2Q9UGN5 583 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 GBF1Q92538 1859 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 NDC80O14777 642 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 B4GALT3O60512 393 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 LRCH4O75427 683 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 DGKIO75912 1065 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PAFAH1B1P43034 410 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SCNN1GP51170 649 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SEMA3BQ13214 749 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MTFR1Q15390 333 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CCNG2Q16589 344 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ARMC3Q5W041 872 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 DUPD1Q68J44 220 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PMF1Q6P1K2 205 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 UBXN4Q92575 508 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 KRT35Q92764 455 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ZFP42Q96MM3 310 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 NPY6RQ99463 290 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PLVAPQ9BX97 442 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.79□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MYO1FO00160 1098 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 DDHD2O94830 711 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 KRT19P08727 400 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 KRT7P08729 469 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CDKN2BP42772 138 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MAGEA6P43360 314 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TNK2Q07912 1038 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MTA1Q13330 715 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PDK2Q15119 407 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 DPYSL2Q16555 572 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FAM35AQ86V20 835 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PRELID2Q8N945 189 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PNKPQ96T60 521 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CHST7Q9NS84 486 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FNIP2Q9P278 1114 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 M0QYV0 167 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 HSF2BPO75031 334 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SRGAP2O75044 1071 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 GPD1P21695 349 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 LMO2P25791 158 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 TAS2R40P59535 323 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PTK6Q13882 451 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC14Q49A88 953 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 VSTM1Q6UX27 236 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC43Q8N309 656 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF592Q92610 1267 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SMOQ99835 787 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SYT15Q9BQS2 421 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 SNX25Q9H3E2 840 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 STIM2Q9P246 746 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CLTBP09497 229 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PYGMP11217 842 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 KRT3P12035 628 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CD58P19256 250 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ABCB4P21439 1286 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 PDE4CQ08493 712 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 ELF2Q15723 593 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 EMC10Q5UCC4 262 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 EMBQ6PCB8 327 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.78□□□□□ -1.32
PRKCI-202ENST00000476635 BBS12Q6ZW61 710 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms