RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 SLC2A14Q8TDB8 520 aa31.11■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 ZFYVE19Q96K21 471 aa31.11■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 KRT82Q9NSB4 513 aa31.11■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 ZMYM5Q9UJ78 669 aa31.11■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 CCL26Q9Y258 94 aa31.11■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 AP1G2O75843 785 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 DCNP07585 359 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 FCHO2Q0JRZ9 810 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 FOXR2Q6PJQ5 311 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 BPIFB1Q8TDL5 484 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 WHAMMQ8TF30 809 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 SMARCD1Q96GM5 515 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 ARID3AQ99856 593 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 TTLL2Q9BWV7 592 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 NT5C1AQ9BXI3 368 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 LMBRD1Q9NUN5 540 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 OBP2AQ9NY56 170 aa31.1■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 KANSL1LA0AUZ9 987 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 C2orf78A6NCI8 922 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 CILPO75339 1184 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 ADORA2BP29275 332 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 TCF15Q12870 199 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF394Q53GI3 561 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 SLC22A12Q96S37 553 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 CYP2S1Q96SQ9 504 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 PRRX2Q99811 253 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 COQ4Q9Y3A0 265 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 SIT1Q9Y3P8 196 aa31.09■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 CHADO15335 359 aa31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 FMO5P49326 533 aa31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 UBXN2BQ14CS0 331 aa31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 PJA1Q8NG27 643 aa31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 FAM122AQ96E09 287 aa31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 TDP1Q9NUW8 608 aa31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 EHD2Q9NZN4 543 aa31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
FBXO18-208ENST00000470089 ARNTLO00327 626 aa31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 BEST1O76090 585 aa31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 NUP93Q8N1F7 819 aa31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TTC16Q8NEE8 873 aa31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 SMOQ99835 787 aa31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 CISHQ9NSE2 258 aa31.07■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 SOBPA7XYQ1 873 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 CKMP06732 381 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 PLA2G5P39877 138 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 MAP3K7CLP57077 242 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 LRMPQ12912 555 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TAF10Q12962 218 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 ZMIZ2Q8NF64 920 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TTC8Q8TAM2 541 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 NUP62CLQ9H1M0 184 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 LTB4R2Q9NPC1 389 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TRPV5Q9NQA5 729 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 PIAS3Q9Y6X2 628 aa31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 HELZP42694 1942 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 SHISA7A6NL88 538 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 ABL1P00519 1130 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 NUBP1P53384 320 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 PTPN5P54829 565 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC105Q8IYK2 499 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 DTWD2Q8NBA8 298 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 SCAMP5Q8TAC9 235 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 RIN3Q8TB24 985 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 CYFIP2Q96F07 1278 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 FAXDC2Q96IV6 333 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 GBP4Q96PP9 640 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 GCNT4Q9P109 453 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 RWDD2AQ9UIY3 292 aa31.05■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 PATJQ8NI35 1801 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 FAM170BA6NMN3 283 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 TNFRSF10BO14763 440 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 USP17L7P0C7H9 530 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 FAM200BP0CF97 657 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 YWHAQP27348 245 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 SLC5A3P53794 718 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF852Q6ZMS4 543 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 FBXO32Q969P5 355 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 SLITRK1Q96PX8 696 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 KIF9Q9HAQ2 790 aa31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF840PA6NDX5 716 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 H0Y858 1186 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 GNA14O95837 355 aa31.03■■■□□ 2.56
FBXO18-208ENST00000470089 GLULP15104 373 aa31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms