RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 EPCAMP16422 314 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 HIC1Q14526 733 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 AMHR2Q16671 573 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CEP120Q8N960 986 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 WHAMMQ8TF30 809 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 KLHL29Q96CT2 875 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 BCO2Q9BYV7 579 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 EPN3Q9H201 632 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TEX28O15482 410 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MAP3K13O43283 966 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 DAPK3O43293 454 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FGF19O95750 216 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MYL1P05976 194 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CD58P19256 250 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CTNNA2P26232 953 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 STX2P32856 288 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CLCNKBP51801 687 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF131P52739 623 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ADAM17P78536 824 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GDAP1Q8TB36 358 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC77Q9BR77 488 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GPR88Q9GZN0 384 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 RAB17Q9H0T7 212 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TBK1Q9UHD2 729 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 AMACRQ9UHK6 382 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SNX24Q9Y343 169 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 NID2Q14112 1375 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 HIDE1A8MVS5 230 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 IL9P15248 144 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PDE6CP51160 858 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC14Q15048 493 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC38Q502W7 563 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GANCQ8TET4 914 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM7Q9C029 511 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PCNTO95613 3336 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1W2PQC6 194 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MYMKA6NI61 221 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 KPNA7A9QM74 516 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ADAMTS3O15072 1205 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SPTLC1O15269 473 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GFPT2O94808 682 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FGGP02679 453 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MMEP08473 750 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 STAT1P42224 750 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FAM189BP81408 668 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MXRA7P84157 204 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 HYAL1Q12794 435 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 DUSP4Q13115 394 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MDM1Q8TC05 714 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GIPC2Q8TF65 315 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PTPRFP10586 1907 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms