RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNH6Q9H252 994 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT82Q9NSB4 513 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF263O14978 683 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TADA3O75528 432 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM200BP0CF97 657 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 AVPR2P30518 371 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 GDI1P31150 447 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP3CCP48454 512 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 PDE6CP51160 858 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 CACNA2D1P54289 1103 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 PRKCQQ04759 706 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TXNDC8Q6A555 127 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 MON1AQ86VX9 555 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP93Q8N1F7 819 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 C12orf29Q8N999 325 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TATDN2Q93075 761 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 NT5C1BQ96P26 610 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TWNKQ96RR1 684 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 PRRX2Q99811 253 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 CISHQ9NSE2 258 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 COL4A2P08572 1712 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 MBD3O95983 291 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 ADORA2BP29275 332 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 USP46P62068 366 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNH2Q12809 1159 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CUL2Q13617 745 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF394Q53GI3 561 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CYFIP2Q96F07 1278 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CHADO15335 359 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 PRAMEF12O95522 483 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CKMP06732 381 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 USP17L7P0C7H9 530 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 NPR3P17342 541 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 PFKLP17858 780 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 AOC1P19801 751 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 YWHAQP27348 245 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 NUBP1P53384 320 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 STARD6P59095 220 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 PLCB2Q00722 1185 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 LRMPQ12912 555 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 GPIHBP1Q8IV16 184 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 PDZD8Q8NEN9 1154 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 GPT2Q8TD30 523 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 WHAMMQ8TF30 809 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO32Q969P5 355 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 RSPRY1Q96DX4 576 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNK16Q96T55 309 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 ARID3AQ99856 593 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 TDP1Q9NUW8 608 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 COMMD8Q9NX08 183 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 NCANO14594 1321 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC5A3P53794 718 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP3K7CLP57077 242 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 TAF10Q12962 218 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-205ENST00000466097 SMOQ99835 787 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms