RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SOBPA7XYQ1 873 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 YWHAQP27348 245 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 AVPR1AP37288 418 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 VIPR2P41587 438 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 USP46P62068 366 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 GCNT1Q02742 428 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TXNDC8Q6A555 127 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM270Q6UE05 265 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 FAM81BQ96LP2 452 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SMOQ99835 787 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 NDST4Q9H3R1 872 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TECTAO75443 2155 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TPM2P07951 284 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 CFHP08603 1231 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 CD19P15391 556 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 FCARP24071 287 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PPP3CCP48454 512 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 GPC5P78333 572 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 MYL5Q02045 173 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 MON1AQ86VX9 555 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 COMMD8Q9NX08 183 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PRR33A8MZF0 331 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 BEST1O76090 585 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ABL1P00519 1130 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SLC9A1P19634 815 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 WEE1P30291 646 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SLC8A3P57103 927 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TAF10Q12962 218 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SGO2Q562F6 1265 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 YAF2Q8IY57 180 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 UBR7Q8N806 425 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 KAT5Q92993 513 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 FBXO32Q969P5 355 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 DUSP16Q9BY84 665 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 FANCLQ9NW38 375 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 WNT16Q9UBV4 365 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PAEPP09466 180 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 VDRP11473 427 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 NPR3P17342 541 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PSMC3P17980 439 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PDE6CP51160 858 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SLC5A3P53794 718 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 MFAP3P55082 362 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PFKPQ01813 784 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 GRM2Q14416 872 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ASIC4Q96FT7 647 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 BRD9Q9H8M2 597 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 HESX1Q9UBX0 185 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TNFRSF10BO14763 440 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TADA3O75528 432 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PON1P27169 355 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 MIIPQ5JXC2 388 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms