RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNE1P24864 410 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 MXI1P50539 228 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM35AQ86V20 835 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 UNC93AQ86WB7 457 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC8Q8TAM2 541 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM3CQ92520 227 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC22A12Q96S37 553 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 F5P12259 2224 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 C2orf78A6NCI8 922 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 BIN1O00499 593 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NCAM2O15394 837 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CKMP06732 381 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SOX9P48436 509 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 MRE11P49959 708 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 PLCB2Q00722 1185 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 FUKQ8N0W3 1084 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMA4DQ92854 862 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNK16Q96T55 309 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 PATJQ8NI35 1801 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L7P0C7H9 530 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC130P13994 396 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 BMP6P22004 513 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R2P41236 205 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE2HP62256 183 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TNK2Q07912 1038 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 INCA1Q0VD86 236 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 MORC3Q14149 939 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NUP93Q8N1F7 819 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 RIN3Q8TB24 985 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CLDN23Q96B33 292 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TWNKQ96RR1 684 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 GKN1Q9NS71 199 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT82Q9NSB4 513 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 GCNT4Q9P109 453 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 AP1G2O75843 785 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CD58P19256 250 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF10Q12962 218 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 FZD5Q13467 585 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 C12orf29Q8N999 325 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB20Q9NX57 234 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ABL1P00519 1130 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 HDCP19113 662 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CTHP32929 405 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEA9P43362 315 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CBWD6Q4V339 395 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC16Q8NEE8 873 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NELFBQ8WX92 580 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 MSANTD3Q96H12 275 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 CILPO75339 1184 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 YWHAQP27348 245 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ADORA2BP29275 332 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NBL1P41271 181 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP3CCP48454 512 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms