RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.13■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.13■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.13■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM66O15016 1216 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 HLA-DRAP01903 254 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 DCNP07585 359 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MAGEA9P43362 315 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CYP27A1Q02318 531 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CLDN23Q96B33 292 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MSANTD3Q96H12 275 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TNIP3Q96KP6 325 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.12■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MAN2B1O00754 1011 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 DPYSL4O14531 572 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CETN3O15182 167 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM49P0CI25 452 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM49CP0CI26 452 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 GRIK1P39086 918 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ASPAP45381 313 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 UNC93AQ86WB7 457 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 BCO2Q9BYV7 579 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 F5P12259 2224 aa23.11■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 FAM170BA6NMN3 283 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PROB1E7EW31 1015 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 KINO60870 393 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CD72P21854 359 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 AVPR1AP37288 418 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PIK3CAP42336 1068 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 RAP1GAPP47736 663 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 GCLMP48507 274 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PLCB2Q00722 1185 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 LRRC63Q05C16 580 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 FZD5Q13467 585 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ANGPT1Q15389 498 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TXNDC8Q6A555 127 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 YAF2Q8IY57 180 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PHOX2BQ99453 314 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 TDP1Q9NUW8 608 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 EHD2Q9NZN4 543 aa23.1■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 F8VP50 259 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 LRRN2O75325 713 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PFKLP17858 780 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PPP1R2P41236 205 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 RPS9P46781 194 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CACNA2D1P54289 1103 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 INCA1Q0VD86 236 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 KRT39Q6A163 491 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 FOXR2Q6PJQ5 311 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PIAS3Q9Y6X2 628 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MYO15AQ9UKN7 3530 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.09■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 NCAM2O15394 837 aa23.08■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 ANXA13P27216 316 aa23.08■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 NBL1P41271 181 aa23.08■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 PPP3CCP48454 512 aa23.08■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 MRE11P49959 708 aa23.08■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 USP46P62068 366 aa23.08■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.08■■□□□ 1.29
CDIPT-210ENST00000570016 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.08■■□□□ 1.29
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