RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 PMM2O15305 246 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ECI2O75521 394 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 SRFP11831 508 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC130P13994 396 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ANXA13P27216 316 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 KCNH2Q12809 1159 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 GPR158Q5T848 1215 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 FUKQ8N0W3 1084 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 C12orf29Q8N999 325 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 WHAMMQ8TF30 809 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 C8orf48Q96LL4 319 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 MYRFLQ96LU7 910 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 GPR88Q9GZN0 384 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 PTPRDP23468 1912 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ATP8B3O60423 1300 aa22.25■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 F11P03951 625 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 LRMPQ12912 555 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 CISHQ9NSE2 258 aa22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 P4HA2O15460 535 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TADA3O75528 432 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 CFHP08603 1231 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 CETN1Q12798 172 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 CUL2Q13617 745 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TASP1Q9H6P5 420 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 KRT82Q9NSB4 513 aa22.23■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 VIPR2P41587 438 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 USP46P62068 366 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF394Q53GI3 561 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TTC39CQ8N584 583 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 LMO3Q8TAP4 145 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 KCNK16Q96T55 309 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 THAP9Q9H5L6 903 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 NCANO14594 1321 aa22.22■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 AP1G2O75843 785 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ADORA2BP29275 332 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 GPC5P78333 572 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 NT5C1BQ96P26 610 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TMOD3-203ENST00000558455 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 RAD23BP54727 409 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 GRM2Q14416 872 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 TXNDC8Q6A555 127 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 VITQ6UXI7 678 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 SMOQ99835 787 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 WNT16Q9UBV4 365 aa22.2■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 PRAMEF12O95522 483 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 FAM200BP0CF97 657 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 SIX5Q8N196 739 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TMOD3-203ENST00000558455 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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