RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ZNF677Q86XU0 584 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 STKLD1Q8NE28 680 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CPXM1Q96SM3 734 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SMOQ99835 787 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 KRT82Q9NSB4 513 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CARNS1A5YM72 827 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 HHLA1C9JL84 531 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 H3BNC9 293 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PIK3R2O00459 728 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MED7O43513 233 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 AP1G2O75843 785 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SEC24AO95486 1093 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ERBB2P04626 1255 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RB1P06400 928 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CPB1P15086 417 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CYP2F1P24903 491 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ARHGAP25P42331 645 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RGS7P49802 495 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 BCAT1P54687 386 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 KRT17Q04695 432 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GPR17Q13304 367 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PDCLQ13371 301 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GPM6BQ13491 265 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 HS1BP3Q53T59 392 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PMF1Q6P1K2 205 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MON1BQ7L1V2 547 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TIFAQ96CG3 184 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 KCNK16Q96T55 309 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TCF25Q9BQ70 676 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MED10Q9BTT4 135 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ISCUQ9H1K1 167 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LHX5Q9H2C1 402 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TLR9Q9NR96 1032 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MSRAQ9UJ68 235 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LZTS1Q9Y250 596 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MYO7AQ13402 2215 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 F8VP50 259 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LPXNO60711 386 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ABLIM3O94929 683 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GJB6O95452 261 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CXCL14O95715 111 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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CS-216ENST00000549221 GZMAP12544 262 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NPR3P17342 541 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ABCB4P21439 1286 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MMP8P22894 467 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CA8P35219 290 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MAGEA1P43355 309 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GALCP54803 685 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MAP3K7CLP57077 242 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 UBE3AQ05086 875 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RAB33AQ14088 237 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 STILQ15468 1287 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TMC7Q7Z402 723 aa8.61□□□□□ -1.03
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