RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 RITA1Q96K30 269 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 NACADO15069 1562 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TRIM38O00635 465 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 IL33O95760 270 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 HMCESQ96FZ2 354 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.13□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 ERC2O15083 957 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 USP1O94782 785 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 MVB12AQ96EY5 273 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 LRPAP1P30533 357 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 NR4A2P43354 598 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PDE6CP51160 858 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 FHL1Q13642 323 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 FCRL6Q6DN72 434 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 AWAT2Q6E213 333 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 KRT73Q86Y46 540 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TERB1Q8NA31 727 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 WACQ9BTA9 647 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 XPR1Q9UBH6 696 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 GABRQQ9UN88 632 aa6.11□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 EXOC3O60645 756 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 BCAR3O75815 825 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PDE8BO95263 885 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 NTN1O95631 604 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PRKCBP05771 671 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 AKAP5P24588 427 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 RABEP1Q15276 862 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 SNX18Q96RF0 628 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 E5RJQ4 531 aa6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 CYP2C9P11712 490 aa6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 MYO1EQ12965 1108 aa6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TMX2Q9Y320 296 aa6.09□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 MYO1CO00159 1063 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CSF1RP07333 972 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 VCAM1P19320 739 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 RENBPP51606 427 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 KRT17Q04695 432 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 Q4G0T1 1027 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MAP3K14Q99558 947 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CIPCQ9C0C6 399 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 MED16Q9Y2X0 877 aa6.08□□□□□ -1.44
SGCE-211ENST00000522045 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
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