RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 PSMA7O14818 248 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CD72P21854 359 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 WEE1P30291 646 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 NDST1P52848 882 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 USP46P62068 366 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 PRKCQQ04759 706 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 LRRC63Q05C16 580 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 KRT39Q6A163 491 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 ACOT1Q86TX2 421 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 E2F7Q96AV8 911 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 SHDQ96IW2 340 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 SPATA17Q96L03 361 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 PRRX2Q99811 253 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 BCO2Q9BYV7 579 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 SHISA7A6NL88 538 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 ARNTLO00327 626 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DPYSL4O14531 572 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF263O14978 683 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 TRIM66O15016 1216 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DCNP07585 359 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 MXI1P50539 228 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 NUBP1P53384 320 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 PTPN5P54829 565 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 NHLH1Q02575 133 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 STIM1Q13586 685 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CAMK4Q16566 473 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 MON1AQ86VX9 555 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 YAF2Q8IY57 180 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CMTM8Q8IZV2 173 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 NELFBQ8WX92 580 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DNASE1L2Q92874 299 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 IRF7Q92985 503 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 C8orf48Q96LL4 319 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 TWNKQ96RR1 684 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CCL26Q9Y258 94 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 SIT1Q9Y3P8 196 aa15□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 GLULP15104 373 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 ANXA13P27216 316 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CBWD6Q4V339 395 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 TTI2Q6NXR4 508 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM35AQ86V20 835 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 FUKQ8N0W3 1084 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 PJA1Q8NG27 643 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 TNIP3Q96KP6 325 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC22A12Q96S37 553 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 MED10Q9BTT4 135 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 OBP2AQ9NY56 170 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 COL4A3Q01955 1670 aa14.99□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 F5P12259 2224 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM170BA6NMN3 283 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 H0Y858 1186 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CHADO15335 359 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 STX10O60499 249 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC130P13994 396 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CD58P19256 250 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 AVPR1AP37288 418 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP1R2P41236 205 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 INCA1Q0VD86 236 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 UNC93AQ86WB7 457 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 C12orf29Q8N999 325 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.98□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 RIN3Q8TB24 985 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms