RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TSG101	Q99816	390 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	GRIK1	P39086	918 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	STARD6	P59095	220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	USP46	P62068	366 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PFKP	Q01813	784 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	NHLH1	Q02575	133 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TAF4B	Q92750	862 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876		F8VP50	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ARNTL	O00327	626 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PSMA7	O14818	248 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CCNE1	P24864	410 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MXI1	P50539	228 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	NDST1	P52848	882 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	UBE2H	P62256	183 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ENPEP	Q07075	957 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MORC3	Q14149	939 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876		H0Y858	1186 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	P4HA1	P13674	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC130	P13994	396 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	GLUL	P15104	373 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ANXA13	P27216	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PTPN5	P54829	565 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	STIM1	Q13586	685 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CAMK4	Q16566	473 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	KRT39	Q6A163	491 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	IRF7	Q92985	503 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SHD	Q96IW2	340 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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