RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	KRT17	Q04695	432 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	DMTN	Q08495	405 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF365	Q70YC5	407 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SERINC5	Q86VE9	423 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ART4	Q93070	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SNF8	Q96H20	258 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZIM3	Q96PE6	472 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CPXM1	Q96SM3	734 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TBCB	Q99426	244 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CNPY3	Q9BT09	278 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SNX25	Q9H3E2	840 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	IPP	Q9Y573	584 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		10.14	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	HUS1	O60921	280 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM153B	P0C7A2	387 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RALA	P11233	206 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ATF2	P15336	505 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GPD1	P21695	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	HSD17B3	P37058	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TAS2R40	P59535	323 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TAZ	Q16635	292 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM153C	Q494X1	144 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	EMC10	Q5UCC4	262 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TTC27	Q6P3X3	843 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM228A	Q86W67	206 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	APPL2	Q8NEU8	664 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TEKT4	Q8WW24	435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRIB2	Q92519	343 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	HSFY1	Q96LI6	401 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TWNK	Q96RR1	684 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM7	Q9C029	511 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	DPH5	Q9H2P9	285 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	UST	Q9Y2C2	406 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.13	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ADAMTS4	O75173	837 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ITGAV	P06756	1048 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RARG	P13631	454 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FGFR4	P22455	802 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CDKN2B	P42772	138 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FLT3LG	P49771	235 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PMS2	P54278	862 aa		10.12	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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