RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	GORAB	Q5T7V8	394 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ICE2	Q659A1	982 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PCSK4	Q6UW60	755 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SMC5	Q8IY18	1101 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MPP5	Q8N3R9	675 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	OR2C3	Q8N628	320 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SLC15A4	Q8N697	577 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	KLC4	Q9NSK0	619 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	STK32B	Q9NY57	414 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	COL20A1	Q9P218	1284 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	FNIP2	Q9P278	1114 aa		5	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	POM121B	A6NF01	834 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SUV39H1	O43463	412 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TYRP1	P17643	537 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PROZ	P22891	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TNFSF4	P23510	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	CXCR5	P32302	372 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ADRA1B	P35368	520 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF134	P52741	427 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	LILRA4	P59901	499 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	KRT17	Q04695	432 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	E2F2	Q14209	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	KAZN	Q674X7	775 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454		F8W8V4	182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TLR5	O60602	858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	NXPH3	O95157	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	KLRC1	P26715	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MAML1	Q92585	1016 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PBK	Q96KB5	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	CHRM2	P08172	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TSHR	P16473	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	GRIA3	P42263	894 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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