RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 PNOCQ13519 176 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 VEPH1Q14D04 833 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 STXBP5Q5T5C0 1151 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR158Q5T848 1215 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAB3Q8WWW8 586 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 DMAC2Q9NW81 257 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR6C75A6NL08 312 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLIC2O15247 247 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 EPN2O95208 641 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF806P0C7X5 589 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAX3P23760 479 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2HP62256 183 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 STPG1Q5TH74 334 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF43Q68DV7 783 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMC8Q8IU68 726 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 EXOC4Q96A65 974 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 RSPRY1Q96DX4 576 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOXL4Q96JB6 756 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM84AQ96KN4 292 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPP3Q9NY33 737 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 OBP2AQ9NY56 170 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASB3Q9Y575 518 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 THADAQ6YHU6 1953 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF233A6NK53 670 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDXKO00764 312 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 OAZ2O95190 189 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ODC1P11926 461 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PMLP29590 882 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDC25CP30307 473 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPLP40238 635 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP4F8P98187 520 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 AMPD2Q01433 879 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR17Q13304 367 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCINQ13939 588 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMD6Q15008 389 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELF2Q15723 593 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 NFIL3Q16649 462 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMG2Q969U7 264 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM209Q96SK2 561 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 INTS13Q9NVM9 706 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIX4Q9UIU6 781 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 MTMR11A4FU01 709 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP11A1P05108 521 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 TYMPP19971 482 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 HOXA6P31267 233 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 AVPR1AP37288 418 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP2J2P51589 502 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNK2Q07912 1038 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP24A1Q07973 514 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 BFSP1Q12934 665 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYBPC2Q14324 1141 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 SURF1Q15526 300 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 KBTBD6Q86V97 674 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR49Q8IV35 697 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 SENP8Q96LD8 212 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 GSDMAQ96QA5 445 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 VPS45Q9NRW7 570 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms