RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXP2O15409 715 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRSS2P07478 247 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RHOP08100 348 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS2P15880 293 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNJ6P48051 423 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RFX2P48378 723 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCYT1AP49585 367 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ROM1Q03395 351 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MEI1Q5TIA1 1274 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLNKQ7Z7G1 428 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EPHX4Q8IUS5 362 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DRC7Q8IY82 874 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LITAFQ99732 161 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MACROD1Q9BQ69 325 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POFUT1Q9H488 388 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM30AQ9NZY2 134 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GAKO14976 1311 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TREHO43280 583 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR47O94967 919 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SOD2P04179 222 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IMPDH2P12268 514 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTGER3P43115 390 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALDH9A1P49189 494 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSG6Q00889 435 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC39A14Q15043 492 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ODF3L2Q3SX64 289 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIRREL2Q6UWL6 708 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C9orf139Q6ZV77 190 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 E2F7Q96AV8 911 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FKBP10Q96AY3 582 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APBA2Q99767 749 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VGLL1Q99990 258 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RSRP1Q9BUV0 290 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TXNRD2Q9NNW7 524 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYOZ2Q9NPC6 264 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNQ5Q9NR82 932 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSFX1Q9UBD0 423 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APCP25054 2843 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RASSF10A6NK89 507 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAFGO15525 162 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 XPNPEP2O43895 674 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GREM1O60565 184 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRLP01236 227 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALDH2P05091 517 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RARBP10826 455 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NAT2P11245 290 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FGF5P12034 268 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SDHAP31040 664 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYP2C18P33260 490 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLK1P49759 484 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FLT3LGP49771 235 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GFRA1P56159 465 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BCAR1P56945 870 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM189A2Q15884 450 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GDPD4Q6W3E5 623 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF793Q6ZN11 406 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LMNTD2Q8IXW0 634 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POC1AQ8NBT0 407 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM145Q8NBT3 493 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC35B2Q8TB61 432 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATRIPQ8WXE1 791 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HERVK_113Q902F9 699 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CEP95Q96GE4 821 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LINC00479Q96M42 142 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF285Q96NJ3 590 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POMT2Q9UKY4 750 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHA12Q9UN75 941 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NEU2Q9Y3R4 380 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 INSL5Q9Y5Q6 135 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC12A7Q9Y666 1083 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KMT2AQ03164 3969 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLHL33A6NCF5 533 aa-0.59□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms