RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259154.8

KCTD3-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD3, Length 3,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3-201ENST00000259154 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 DOLKQ9UPQ8 538 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 UBE4BO95155 1302 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 RPTORQ8N122 1335 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ARP10275 920 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 GALK1P51570 392 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 JAG1P78504 1218 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 FAAP100Q0VG06 881 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 FSTL1Q12841 308 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 AP3B2Q13367 1082 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 NRF1Q16656 503 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 CENPTQ96BT3 561 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 CEP41Q9BYV8 373 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 WHRNQ9P202 907 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 THEGQ9P2T0 379 aa15.5■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 RPS6KA3P51812 740 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ANO7Q6IWH7 933 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 SLC7A3Q8WY07 619 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 SERPINI1Q99574 410 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 DCLK3Q9C098 648 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 KRT3P12035 628 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 PKNOX1P55347 436 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 TNNC2P02585 160 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 TPBGLP0DKB5 382 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 GTF2H1P32780 548 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ROR1Q01973 937 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 KLC2Q9H0B6 622 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 CIITAP33076 1130 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 DCAF4Q8WV16 495 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 TLCD1Q96CP7 247 aa15.49■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 HLA-DRAP01903 254 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ELK3P41970 407 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ITKQ08881 620 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 FLOT2Q14254 428 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 NETO2Q8NC67 525 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 COPAP53621 1224 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ZNF720Q7Z2F6 126 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 SEMA4DQ92854 862 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 PARVAQ9NVD7 372 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 AKAP10O43572 662 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 DCXO43602 365 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 RAG1P15918 1043 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 GLRBP48167 497 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 NME5P56597 212 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ARSHQ5FYA8 562 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 CES3Q6UWW8 571 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 RMDN3Q96TC7 470 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 CYLDQ9NQC7 956 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 OLFML3Q9NRN5 406 aa15.48■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 H0YGN5 161 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 IL1R1P14778 569 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 KIF19Q2TAC6 998 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 CYGBQ8WWM9 190 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 NFS1Q9Y697 457 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 NAV1Q8NEY1 1877 aa15.47■□□□□ 0.07
KCTD3-201ENST00000259154 F8VP50 259 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms