RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	STARD3	Q14849	445 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ELF2	Q15723	593 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ANKS6	Q68DC2	871 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMIM5	Q71RC9	77 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	IQCD	Q96DY2	449 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SCLT1	Q96NL6	688 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	TCF25	Q9BQ70	676 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	CD320	Q9NPF0	282 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	JKAMP	Q9P055	326 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ABCC6	O95255	1503 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	MATN2	O00339	956 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	PJA2	O43164	708 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	B4GALT4	O60513	344 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	FGA	P02671	866 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	GNAI2	P04899	355 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	MPEG1	Q2M385	716 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF365	Q70YC5	407 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM124A	Q86V42	546 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	CPXCR1	Q8N123	301 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCT6B	Q92526	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF566	Q969W8	418 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	USP47	Q96K76	1375 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF785	A8K8V0	405 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931		B5MCH6	92 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	HAUS5	O94927	633 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	UNC5C	O95185	931 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	AMH	P03971	560 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ALAS1	P13196	640 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	FGFR2	P21802	821 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	CLRN1	P58418	232 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC00310	P59036	64 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAC3	P60763	192 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMF1	P82094	1093 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ICA1	Q05084	483 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	DUSP8	Q13202	625 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	CTBP1	Q13363	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAB32	Q13637	225 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	MICU3	Q86XE3	530 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	XYLT1	Q86Y38	959 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	MPP5	Q8N3R9	675 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	MYCT1	Q8N699	235 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SNX22	Q96L94	193 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	SERHL	Q9NQF3	203 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	RLIM	Q9NVW2	624 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	PAPPA	Q13219	1627 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	MEGF6	O75095	1541 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	USP54	Q70EL1	1684 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	CYP27B1	O15528	508 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	POMC	P01189	267 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	TH	P07101	528 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	BLMH	Q13867	455 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC38	Q502W7	563 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SMARCA2-231	ENST00000634931	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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