RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591971.5

PDE4A-208, Transcript of phosphodiesterase 4A, human

TSL 5

Gene PDE4A, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4A-208	ENST00000591971	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	NELL1	Q92832	810 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	IRF7	Q92985	503 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971		R4GN57	208 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	LAMA1	P25391	3075 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CHAD	O15335	359 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	HUS1	O60921	280 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	KRT19	P08727	400 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	RFX1	P22670	979 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	STIM1	Q13586	685 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SURF1	Q15526	300 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	DDR2	Q16832	855 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	DPH6	Q7L8W6	267 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CHFR	Q96EP1	664 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	OBP2A	Q9NY56	170 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CEP250	Q9BV73	2442 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF263	O14978	683 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	NOL4	O94818	638 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	FGF19	O95750	216 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CHRNB1	P11230	501 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CDC25C	P30307	473 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	MAGEA9	P43362	315 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SOX9	P48436	509 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	LHX1	P48742	406 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CASP4	P49662	377 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CYP2J2	P51589	502 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	NLRP12	P59046	1061 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CLDN10	P78369	228 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	TSPY1	Q01534	308 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	PNOC	Q13519	176 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CAMK4	Q16566	473 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	TNNC2	P02585	160 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	MYL7	Q01449	175 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	NELL2	Q99435	816 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PDE4A-208	ENST00000591971	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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