RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577498.1

IFT20-204, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-204ENST00000577498 SYNCQ9H7C4 482 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 DNAH12Q6ZR08 3092 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 MYO1FO00160 1098 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SYN3O14994 580 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 MAN1A1P33908 653 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SLC1A1P43005 524 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 BRCC3P46736 316 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 OR1G1P47890 313 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PLCB3Q01970 1234 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 MESDQ14696 234 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 XYLT1Q86Y38 959 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 THEM5Q8N1Q8 247 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 MNS1Q8NEH6 495 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SLC35F5Q8WV83 523 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 IP6K2Q9UHH9 426 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ALG6Q9Y672 507 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 LTBP2Q14767 1821 aa16■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 TMEM191CA6NGB0 347 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 BAIAP3O94812 1187 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PROSCO94903 275 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ERBB2P04626 1255 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ALDH2P05091 517 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ITGB1P05556 798 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CCDC130P13994 396 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CTNNA2P26232 953 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ACADSBP45954 432 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 GATMP50440 423 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SLC8A3P57103 927 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 TUBB4BP68371 445 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 C2CD6Q53TS8 623 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 OVOS1Q6IE37 1185 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 TMEM110Q86TL2 294 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 FUKQ8N0W3 1084 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 MCRS1Q96EZ8 462 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 HSFY1Q96LI6 401 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CARD6Q9BX69 1037 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 DUSP16Q9BY84 665 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 TSC2P49815 1807 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 I3L4J1 428 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 NRP1O14786 923 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ATP2C2O75185 946 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 DGKIO75912 1065 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 AMHP03971 560 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 COMTP21964 271 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ITGB8P26012 769 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ADORA2BP29275 332 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SCNN1AP37088 669 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PLA2G4AP47712 749 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PDE4CQ08493 712 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 FAM171BQ6P995 826 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 HASPINQ8TF76 798 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 TOP1MTQ969P6 601 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 IL23AQ9NPF7 189 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CEP350Q5VT06 3117 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CTAGE15A4D2H0 777 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 CARNS1A5YM72 827 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 KCNK3O14649 394 aa15.97■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
IFT20-204ENST00000577498 SPOPO43791 374 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms