RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 KIZQ2M2Z5 673 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ZNF699Q32M78 642 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 USP38Q8NB14 1042 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TRIM11Q96F44 468 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NUP85Q9BW27 656 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ASB7Q9H672 318 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 NOD2Q9HC29 1040 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 LHX6Q9UPM6 363 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 MGAMO43451 1857 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-204ENST00000546621 CA12O43570 354 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GPR32O75388 356 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KRT38O76015 456 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GSTA1P08263 222 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MYL3P08590 195 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MYBL1P10243 752 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CYP2C9P11712 490 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ALADP13716 330 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CTGFP29279 349 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ADAM17P78536 824 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CENPCQ03188 943 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NAA35Q5VZE5 725 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 JADE1Q6IE81 842 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 LRRC43Q8N309 656 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.19e-7■■□□□ 14.2
CS-204ENST00000546621 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TMEM165Q9HC07 324 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CISHQ9NSE2 258 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SIX4Q9UIU6 781 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ALG6Q9Y672 507 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CFAP73A6NFT4 308 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 THAP12O43422 761 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FAM107AO95990 144 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CFHP08603 1231 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KRT19P08727 400 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 AKR1A1P14550 325 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CD58P19256 250 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 COMTP21964 271 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FGFR4P22455 802 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ATICP31939 592 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GRM5P41594 1212 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ASPAP45381 313 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FCGRTP55899 365 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TNNC1P63316 161 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NOMO3P69849 1222 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 BEX3Q00994 111 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MYO1EQ12965 1108 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HIC1Q14526 733 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MESDQ14696 234 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 E2F5Q15329 346 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.2□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.2□□□□□ -1.1
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