RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	CXCL8	P10145	99 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	BLVRA	P53004	296 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	LAYN	Q6UX15	382 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	AP2B1	P63010	937 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	CIPC	Q9C0C6	399 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	AIM2	O14862	343 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SPTLC1	O15269	473 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	MYL2	P10916	166 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	IL10	P22301	178 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SLC29A2	Q14542	456 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	AKAP3	O75969	853 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	UROD	P06132	367 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	GHR	P10912	638 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	RRM1	P23921	792 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SEC23A	Q15436	765 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	FKBP9	O95302	570 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	CYP11B1	P15538	503 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	AKAP5	P24588	427 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SERPINB9	P50453	376 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	BFSP2	Q13515	415 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	HIC1	Q14526	733 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ANO5	Q75V66	913 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	DGKI	O75912	1065 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TGM2	P21980	687 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	RAD23B	P54727	409 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606		F5H5T6	163 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	MTSS1	O43312	755 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SHMT1	P34896	483 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	PLIN5	Q00G26	463 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SEPT8	Q92599	483 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SLC2A3	P11169	496 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	RAG1	P15918	1043 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TMED1	Q13445	227 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2

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