RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 BEST2Q8NFU1 509 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 OLFM1Q99784 485 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SELENONQ9NZV5 590 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 TLK1Q9UKI8 766 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF536O15090 1300 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 NFASCO94856 1347 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DOCK1Q14185 1865 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PDLIM1O00151 329 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 KRT37O76014 449 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GCNT3O95395 438 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PMS2P54278 862 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DR1Q01658 176 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 KDSRQ06136 332 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SLC18A3Q16572 532 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 C4orf19Q8IY42 314 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 BAP1Q92560 729 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CLRN2A0PK11 232 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 H7C0S8 307 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CDH16O75309 829 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 MFN2O95140 757 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 HERVK_113P62684 666 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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PTPRD-214ENST00000540109 MYCT1Q8N699 235 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 TTC13Q8NBP0 860 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ZWILCHQ9H900 591 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC78A2IDD5 438 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC53A6NM62 1247 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 WNT10BO00744 389 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CLPTM1O96005 669 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PSMC5P62195 406 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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PTPRD-214ENST00000540109 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRD-214ENST00000540109 USTQ9Y2C2 406 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 USP20Q9Y2K6 914 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 IDH3BO43837 385 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 IFNB1P01574 187 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRD-214ENST00000540109 AKR1D1P51857 326 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 KCNH2Q12809 1159 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 TRADDQ15628 312 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 IYDQ6PHW0 289 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SNX25Q9H3E2 840 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PREBQ9HCU5 417 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FAM196BA6NMK8 535 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RASA4BC9J798 803 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RASA4O43374 803 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GTF2H1P32780 548 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ARFIP2P53365 341 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RGS21Q2M5E4 152 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ARSHQ5FYA8 562 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 MS4A14Q96JA4 679 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ADCK1Q86TW2 530 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SCAIQ8N9R8 606 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 ACER1Q8TDN7 264 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-214ENST00000540109 CCT6BQ92526 530 aa6.32□□□□□ -1.4
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