RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM140Q9NV12 185 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TAF1P21675 1872 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 PJA2O43164 708 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 SGTAO43765 313 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 AKAP5P24588 427 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 PTH1RQ03431 593 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 SLFN5Q08AF3 891 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 CDH19Q9H159 772 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 PRRG2O14669 202 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TEX33O43247 280 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TAF5LO75529 589 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 PF4V1P10720 104 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 KLRK1P26718 216 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 DLGAP5Q15398 846 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 DLK2Q6UY11 383 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 HTR3DQ70Z44 454 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ABHD8Q96I13 439 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 KAZALD1Q96I82 304 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 KCNH6Q9H252 994 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 LDAHQ9H6V9 325 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TDP1Q9NUW8 608 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 NCANO14594 1321 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 FAM205AQ6ZU69 1335 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 CCER2I3L3R5 266 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 GPR32O75388 356 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RFPL1O75677 317 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 AMY1AP04745 511 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ACRV1P26436 265 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 MAN2A2P49641 1150 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RABGGTBP53611 331 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 CDC42EP1Q00587 391 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 CDSNQ15517 529 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 RASAL3Q86YV0 1011 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 MB21D1Q8N884 522 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 SUCLG2Q96I99 432 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 MXD3Q9BW11 206 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 KIF16BQ96L93 1317 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-225ENST00000515835 SCN9AQ15858 1988 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 DTNBO60941 627 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 POU2F2P09086 479 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PDCP20941 246 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TM4SF4P48230 202 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 INHBEP58166 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ATP8B2P98198 1209 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 MTM1Q13496 603 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 IL10RAQ13651 578 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TNFAIP1Q13829 316 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.39□□□□□ -1.23
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