RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TRIAP1	O43715	76 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	KIF20A	O95235	890 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	NPR1	P16066	1061 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PPP3CB	P16298	524 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	HDC	P19113	662 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ITGAL	P20701	1170 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	LOXL3	P58215	753 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GBX1	Q14549	363 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PBK	Q96KB5	322 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	NELL2	Q99435	816 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753		A0A087WWL8	130 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TP73	O15350	636 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	UNC5C	O95185	931 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PRKCG	P05129	697 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CYP2C9	P11712	490 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PHKA1	P46020	1223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MLC1	Q15049	377 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MYO1F	O00160	1098 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	DCLK1	O15075	740 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ZBED1	O96006	694 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GRP	P07492	148 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CD6	P30203	668 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	MAPK7	Q13164	816 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HERC4-215	ENST00000515753	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
HERC4-215	ENST00000515753		A0A1W2PPL8	197 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HERC4-215	ENST00000515753	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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