RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	FSCN2	O14926	492 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	RTN2	O75298	545 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	TACC1	O75410	805 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	EOMES	O95936	686 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	NBL1	P41271	181 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	UBR7	Q8N806	425 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	CASP10	Q92851	521 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ARID3A	Q99856	593 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	PIR	O00625	290 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	MGEA5	O60502	916 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	TH	P07101	528 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	CHRNB2	P17787	502 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	CD58	P19256	250 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	GNA15	P30679	374 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	PPM1A	P35813	382 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ASPA	P45381	313 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	KRT17	Q04695	432 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ITIH3	Q06033	890 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	KCNC3	Q14003	757 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954		C9IYK1	514 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	HOXA2	O43364	376 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	MED7	O43513	233 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	ABL1	P00519	1130 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	MME	P08473	750 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	PAEP	P09466	180 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	PAX3	P23760	479 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	LRPAP1	P30533	357 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	GALC	P54803	685 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	FMO1	Q01740	532 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	SV2C	Q496J9	727 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	GAD1	Q99259	594 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	CWH43	Q9H720	699 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	TFR2	Q9UP52	801 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CIZ1-223	ENST00000491954	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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