RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468150.1

CAMSAP1-205, Transcript of calmodulin regulated spectrin associated protein 1, human

TSL 5

Gene CAMSAP1, Length 284 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAMSAP1-205	ENST00000468150	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CAMSAP1-205	ENST00000468150	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		5.71	□□□□□ -1.49
CAMSAP1-205	ENST00000468150		A0A087X1B8	175 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SHTN1	A0MZ66	631 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ALG1L2	C9J202	215 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	BCAR3	O75815	825 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NDUFA10	O95299	355 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SERPINB2	P05120	415 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ATP5J	P18859	108 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SLC6A2	P23975	617 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KRT85	P78386	507 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	DDR1	Q08345	913 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ACAP2	Q15057	778 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SYNE4	Q8N205	404 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	GPATCH3	Q96I76	525 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TEKT5	Q96M29	485 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	IPP	Q9Y573	584 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	MYH7	P12883	1935 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ATP10D	Q9P241	1426 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KIF16B	Q96L93	1317 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ADCY9	O60503	1353 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ABCC12	Q96J65	1359 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CCDC78	A2IDD5	438 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	MARCH11	A6NNE9	402 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	FOXN1	O15353	648 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	GPR32	O75388	356 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ABHD16A	O95870	558 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	POMC	P01189	267 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ELANE	P08246	267 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	DDC	P20711	480 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ZNF529	Q6P280	563 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ADAM2	Q99965	735 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NYX	Q9GZU5	481 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PSME4	Q14997	1843 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	BMPR1A	P36894	532 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	SUSD4	Q5VX71	490 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	KSR2	Q6VAB6	950 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	COA7	Q96BR5	231 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	AGAP2	Q99490	1192 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PRRX2	Q99811	253 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	TNN	Q9UQP3	1299 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CAMSAP1-205	ENST00000468150	PTPRC	P08575	1304 aa		5.69	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms