RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR2MP0CAP2 368 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CHN1P15882 459 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GAP43P17677 238 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V1C1P21283 382 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CRABP2P29373 138 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ARSDP51689 593 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NFIL3Q16649 462 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.15□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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RABGEF1-202ENST00000380828 PON1P27169 355 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NOS2P35228 1153 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PLCB3Q01970 1234 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM14Q14142 442 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.15□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 GATA6Q92908 595 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM136AQ96C01 138 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DTLQ9NZJ0 730 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF69Q9UC07 566 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 THAP12O43422 761 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 JAK1P23458 1154 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TTKP33981 857 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PHKA1P46020 1223 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PCYT1AP49585 367 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 IFFO2Q5TF58 517 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 AAGABQ6PD74 315 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.14□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.14□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.14□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 MYZAPP0CAP1 466 aa7.14□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 STX8Q9UNK0 236 aa7.14□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNJ18B7U540 433 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 C9IYK1 514 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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