RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 FHL3Q13643 280 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC29A2Q14542 456 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 LY6KQ17RY6 165 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTBD16Q32M84 506 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLFN13Q68D06 897 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 BEND5Q7L4P6 421 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 RRAGAQ7L523 313 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 YAF2Q8IY57 180 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 AOPEPQ8N6M6 819 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q8NA96 180 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA5Q8NB90 893 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CPT1CQ8TCG5 803 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 NACC2Q96BF6 587 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF31Q96EP0 1072 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNC2Q96PR1 638 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERHLQ9NQF3 203 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 LZTS1Q9Y250 596 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A0B4J269 797 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 UNC119BA6NIH7 251 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNPH1O43598 174 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 MFAP3LO75121 409 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS6KA4O75676 772 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 NCR1O76036 304 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHEK2O96017 543 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANXA1P04083 346 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLBP06746 335 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSF1RP07333 972 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 INHBBP09529 407 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARP10275 920 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 CKMT1AP12532 417 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 TPH1P17752 444 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNA3P22001 575 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 MST1P26927 711 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKT1P31749 480 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS19P39019 145 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCF15Q12870 199 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKG1Q13976 671 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGEF7Q14155 803 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 IQCB1Q15051 598 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 MFSD5Q6N075 450 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM71BQ8TC56 605 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q8TCH9 128 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 MIEF2Q96C03 454 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 HPSEQ9Y251 543 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAD54BQ9Y620 910 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms