RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 DPH6Q7L8W6 267 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 NT5DC3Q86UY8 548 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC93AQ86WB7 457 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CREG2Q8IUH2 290 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 UBL4BQ8N7F7 174 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM2Q99965 735 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MIS12Q9H081 205 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SMYD3Q9H7B4 428 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCB6Q9NP58 842 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PARVAQ9NVD7 372 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 STRIP2Q9ULQ0 834 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SCINQ9Y6U3 715 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SIP14410 1827 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 HUS1O60921 280 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP8P22894 467 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PAX3P23760 479 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 LRPAP1P30533 357 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCR5P32302 372 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC1A1P43005 524 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RAP1GAPP47736 663 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 NDST1P52848 882 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MESDQ14696 234 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 AGERQ15109 404 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX35Q5T0J7 233 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MON1BQ7L1V2 547 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PASD1Q8IV76 773 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC4A11Q8NBS3 891 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 APPL2Q8NEU8 664 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6B3Q8NGW1 331 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 COG1Q8WTW3 980 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 TFAP2BQ92481 460 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 HES6Q96HZ4 224 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB118Q96PH6 123 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 GAD1Q99259 594 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMB7Q99436 277 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF208Q9H0X6 261 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT8AQ9H1J5 351 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX25Q9H3E2 840 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 COG5Q9UP83 839 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MGAMO43451 1857 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL5CA6NH57 179 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MXQ7 604 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MSTNO14793 375 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF185O15231 689 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SPOPO43791 374 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 EOMESO95936 686 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SELPP16109 830 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFV2P19404 249 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RRM1P23921 792 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK7P50613 346 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 LILRA4P59901 499 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 TAP1Q03518 808 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 DSC3Q14574 896 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PLVAPQ9BX97 442 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SDCBP2Q9H190 292 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCL16Q9H2A7 254 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNCQ9H7C4 482 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 RSAD1Q9HA92 442 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR35Q9P2L0 1181 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.691e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-201ENST00000319942 V9GYY5 206 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-201ENST00000319942 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.71□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC66A2RUB6 948 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGESO14684 152 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP104O60308 925 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 MCM3P25205 808 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 MLH1P40692 756 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 DNA2P51530 1060 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 MAMLD1Q13495 774 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ELF2Q15723 593 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 DCUN1D2Q6PH85 259 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 LCLAT1Q6UWP7 414 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 TOP6BLQ8N6T0 577 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF169Q8NCN4 708 aa10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms