RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 EPOPA6NHQ4 379 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-201ENST00000246533 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-201ENST00000246533 SYT11Q9BT88 431 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM109Q9BVC6 243 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-201ENST00000246533 CDT1Q9H211 546 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRC5Q86WI3 1866 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL5CA6NH57 179 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF2O75151 1096 aa27.82■■■□□ 2.04
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