RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C GIM5Q04493 163 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C AVO2Q04749 426 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C YMR253CQ04835 414 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C ADH6Q04894 360 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C CNL1Q06333 122 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C KEI1Q06346 221 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C HEM25Q07534 307 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C CSI2Q08054 341 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C SLO1Q3E784 85 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C YNR034W-AQ3E841 98 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C PET20Q99373 253 aa1.53□□□□□ -2.16
CSE4YKL049C COX2P00410 251 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAI3P01094 68 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C COX9P07255 59 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PUT1P09368 476 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU19P0CE85 124 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU21P0CE86 164 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU22P0CE87 164 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C URA5P13298 226 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C POX1P13711 748 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YGL010WP25338 174 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU3P25610 124 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C ERG24P32462 438 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C UPS2P35200 230 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C DOG1P38774 246 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C RPB11P38902 120 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C HSP10P38910 106 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YEA6P39953 335 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C DLS1P40366 167 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C ICE2P40499 491 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C OTU1P43558 301 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU5P43575 122 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C OST2P46964 130 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C GPI14P47088 403 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C BXI1P48558 297 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C THG1P53215 237 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C THI74Q04083 370 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YMR321CQ04898 105 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C ATG10Q07879 167 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C NAT5Q08689 176 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YOR385WQ08909 290 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PEX11Q12462 236 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C WIP1Q2V2P8 89 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C COX19Q3E731 98 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YBL008W-AQ3E821 79 aa1.52□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C MSB2P32334 1306 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YLR422WQ06409 1932 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C MSW1P04803 379 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU1P0CE88 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU14P0CE89 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU6P0CE90 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU18P0CE91 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU8P0CE92 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU11P0CE93 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C MATALPHA1P0CY06 175 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C HMLALPHA1P0CY07 175 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C SPO13P23624 291 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C SUA7P29055 345 aaPredicted RBP1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C RPL14AP36105 138 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YBR096WP38256 230 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YBR220CP38318 560 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C SSH1P38353 490 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU13P38725 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C RPL14BP38754 138 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YEA4P40004 342 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C SPC25P40014 221 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C APQ12P40532 138 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C EAF6P47128 113 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C ERG25P53045 309 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YGL204CP53089 101 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU4P53427 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PDR17P53844 350 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C BUD25P85052 153 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU10Q03050 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C RCE1Q03530 315 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YML079WQ03629 201 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C ATG39Q06159 398 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C NAT3Q06504 195 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YLR030WQ07967 263 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YOL024WQ08172 172 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU20Q08322 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C CSM4Q08955 156 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C HUT1Q12520 339 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PAU9Q3E770 120 aa1.51□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C FMP49A0A023PZB3 126 aa1.5□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C YOR304C-AO14468 76 aa1.5□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C QCR2P07257 368 aa1.5□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C SEC4P07560 215 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C NHP6AP11632 93 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C STE18P18852 110 aa1.5□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C RFA3P26755 122 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C PPA2P28239 310 aa1.5□□□□□ -2.17
CSE4YKL049C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data1.5□□□□□ -2.17not detected
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