RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	SEC24A	O95486	1093 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	NR3C1	P04150	777 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	C8A	P07357	584 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	GJA1	P17302	382 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	GART	P22102	1010 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZP2	Q05996	745 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PAK1	Q13153	545 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ORC1	Q13415	861 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	USP37	Q86T82	979 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	CASP10	Q92851	521 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PNKP	Q96T60	521 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYB561D2	O14569	222 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882		H3BQF6	201 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	NR2F2	P24468	414 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	BIRC3	Q13489	604 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	SUSD3	Q96L08	255 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIR	O00625	290 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRRG1	O14668	218 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP2C2	O75185	946 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	AKAP3	O75969	853 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	KRT9	P35527	623 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	BRD3	Q15059	726 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	UROC1	Q96N76	676 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ASB7	Q9H672	318 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRPAP1	P30533	357 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	DUSP4	Q13115	394 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALCAM	Q13740	583 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	NCK2	O43639	380 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	MYL6	P60660	151 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	UBXN1	Q04323	297 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	BIRC2	Q13490	618 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	F5	P12259	2224 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	TECTA	O75443	2155 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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