RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	FNBP1	Q96RU3	617 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PRRX2	Q99811	253 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PDXK	O00764	312 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	F11	P03951	625 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	MYL1	P05976	194 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	NUBP1	P53384	320 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	CLDN10	P78369	228 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	CYP4F8	P98187	520 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SMARCB1	Q12824	385 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		15.19	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	VNN1	O95497	513 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	NR3C1	P04150	777 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	LHX1	P48742	406 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	MRE11	P49959	708 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	MYL7	Q01449	175 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TSPY1	Q01534	308 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	FZD5	Q13467	585 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	GPR158	Q5T848	1215 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PJA1	Q8NG27	643 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	MMS19	Q96T76	1030 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		15.18	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ARNTL	O00327	626 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PRAMEF12	O95522	483 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PSMC3	P17980	439 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	GDI1	P31150	447 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	CDH8	P55286	799 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ITIH5	Q86UX2	942 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SPATA18	Q8TC71	538 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SYT15	Q9BQS2	421 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	GPR88	Q9GZN0	384 aa		15.17	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	FAM170B	A6NMN3	283 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TACC1	O75410	805 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	AKAP3	O75969	853 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PCSK1	P29120	753 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	NLRP12	P59046	1061 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PFKP	Q01813	784 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PRKCQ	Q04759	706 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PNOC	Q13519	176 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	KCNB1	Q14721	858 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	VEPH1	Q14D04	833 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ANGPT1	Q15389	498 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SDCBP2	Q9H190	292 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TASP1	Q9H6P5	420 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	BRD9	Q9H8M2	597 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	ABCB6	Q9NP58	842 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	CDH9	Q9ULB4	789 aa		15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		15.15	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		15.15	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	PHACTR2	O75167	634 aa		15.15	■□□□□ 0.02
EDC4-210	ENST00000575507	TADA3	O75528	432 aa		15.15	■□□□□ 0.02

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