RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 PTPN5P54829 565 aa23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 ENPEPQ07075 957 aa23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 SPATA20Q8TB22 786 aa23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CDH9Q9ULB4 789 aa23.25■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 PI15O43692 258 aa23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 PRKCQQ04759 706 aa23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 E2F7Q96AV8 911 aa23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TIGD1Q96MW7 591 aa23.24■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 IKBKBO14920 756 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 HCRTO43612 131 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 LMO2P25791 158 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 GABRR2P28476 465 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CDC25CP30307 473 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MYL6P60660 151 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 DNASE1L2Q92874 299 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 SHDQ96IW2 340 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 GSDMAQ96QA5 445 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 SYT15Q9BQS2 421 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TBC1D17Q9HA65 648 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TRPV5Q9NQA5 729 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CACNA1HO95180 2353 aa23.23■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MAGEA11P43364 429 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TRPC3Q13507 836 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 ZACNQ401N2 412 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 VITQ6UXI7 678 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 GIPC2Q8TF65 315 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MMS19Q96T76 1030 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 ZMYM5Q9UJ78 669 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 NME7Q9Y5B8 376 aa23.22■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 NCANO14594 1321 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 VNN1O95497 513 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CSH1P0DML2 217 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CSH2P0DML3 217 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 PSMC3P17980 439 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 NR2F2P24468 414 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CYP2F1P24903 491 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CDR1P51861 262 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 DLG4P78352 724 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 PNOCQ13519 176 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC142Q17RM4 750 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MYRFLQ96LU7 910 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 TASP1Q9H6P5 420 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 RMND1Q9NWS8 449 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 OBP2AQ9NY56 170 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.21■■□□□ 1.31
CDIPT-210ENST00000570016 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 SOBPA7XYQ1 873 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 PHACTR2O75167 634 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 ATP2C2O75185 946 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 AKAP3O75969 853 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 NOL4O94818 638 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 F11P03951 625 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 TNNC1P63316 161 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 NCOA4Q13772 614 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 CEP135Q66GS9 1140 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 VSTM1Q6UX27 236 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.2■■□□□ 1.3
CDIPT-210ENST00000570016 COL4A2P08572 1712 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms