RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 ATP11CQ8NB49 1132 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 OR10H5Q8NGA6 315 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SLC35B2Q8TB61 432 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 MAML1Q92585 1016 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SCLT1Q96NL6 688 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SIK2Q9H0K1 926 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SMURF2Q9HAU4 748 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 GPR35Q9HC97 309 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CLCA2Q9UQC9 943 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CEP83Q9Y592 693 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 THAP12O43422 761 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 B4GALT3O60512 393 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CHEK2O96017 543 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 POMCP01189 267 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 KLRC1P26715 233 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SLURP1P55000 103 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 MCTP1Q6DN14 999 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 BEND5Q7L4P6 421 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CPXCR1Q8N123 301 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SCAMP4Q969E2 229 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ATP7BP35670 1465 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 KIAA0232Q92628 1395 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF785A8K8V0 405 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 NPHP1O15259 732 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 B4GALT4O60513 344 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 GCP02774 474 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CR2P20023 1033 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 FGFR2P21802 821 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SLC6A4P31645 630 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 GRK6P43250 576 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 PHKA1P46020 1223 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 HSPA7P48741 367 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 RAP2BP61225 183 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 BLMHQ13867 455 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SURF1Q15526 300 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 MPEG1Q2M385 716 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 MICU3Q86XE3 530 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 LGI4Q8N135 537 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA5Q8NB90 893 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SNX22Q96L94 193 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CPDO75976 1380 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ALS2Q96Q42 1657 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 A0A087WWL8 130 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CLCA1A8K7I4 914 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 PIP5K1CO60331 668 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CDC14BO60729 498 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 UNC5CO95185 931 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 FGAP02671 866 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 DUSP8Q13202 625 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 FAM83AQ86UY5 434 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 GPR135Q8IZ08 494 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 CCT6BQ92526 530 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 TFAP2CQ92754 450 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-208ENST00000560725 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms