RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 STK32CQ86UX6 486 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 IRF2BP1Q8IU81 584 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC105Q8IYK2 499 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PQLC1Q8N2U9 271 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MSL2Q9HCI7 577 aa2.55□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 SMC4Q9NTJ3 1288 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 SACM1LQ9NTJ5 587 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 STAP2Q9UGK3 403 aa2.55□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 A0A0G2JNJ9 132 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 CCT2P78371 535 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CREMQ03060 361 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PSMD6Q15008 389 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 INSCQ1MX18 579 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 AMOTQ4VCS5 1084 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 CIAPIN1Q6FI81 312 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 MRNIPQ6NTE8 343 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL17Q6TDP4 642 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 RAB11FIP2Q7L804 512 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 FAM129CQ86XR2 697 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 C2CD5Q86YS7 1000 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 PLXDC1Q8IUK5 500 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 NRSN1Q8IZ57 195 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 ABHD4Q8TB40 342 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 CHST8Q9H2A9 424 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 GPRC5DQ9NZD1 345 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 TBX20Q9UMR3 447 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 EPHB3P54753 998 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RTP5Q14D33 572 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 TOMM20Q15388 145 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R3BQ86XI6 285 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 PCDHA6Q9UN73 950 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 C9orf84Q5VXU9 1444 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-218ENST00000509368 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
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PDE4D-218ENST00000509368 LRRC14BA6NHZ5 514 aa2.53□□□□□ -2
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