RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 KCNJ1P48048 391 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 FNTAP49354 379 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SEC24CP53992 1094 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.163e-7■■■■□ 25.1
ANKRD28-201ENST00000399451 EFCAB14O75071 495 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CYGBQ8WWM9 190 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 DNAJC7Q99615 494 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 TFR2Q9UP52 801 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ADCK1Q86TW2 530 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CHI3L2Q15782 390 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 NAGPAQ9UK23 515 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 BLVRAP53004 296 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SNX31Q8N9S9 440 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 DLC1Q96QB1 1528 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM169Q96HH4 297 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 THAP2Q9H0W7 228 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 E2F8A0AVK6 867 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PRR23AA6NEV1 266 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 C5orf58C9J3I9 102 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ETFBP38117 255 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ERVK-24P63145 666 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 DTNBP1Q96EV8 351 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PKP3Q9Y446 797 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 KDM1AO60341 852 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC15A2Q16348 729 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ATG4CQ96DT6 458 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 IL25Q9H293 177 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PSTPIP1O43586 416 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 STX19Q8N4C7 294 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 UBA3Q8TBC4 463 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ADCY3O60266 1144 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIP10Q15642 601 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 VPS33BQ9H267 617 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CD274Q9NZQ7 290 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.163e-8■□□□□ 10.7
ANKRD28-201ENST00000399451 CHSY1Q86X52 802 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CARD9Q9H257 536 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 BLOC1S6Q9UL45 172 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF711Q9Y462 761 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ODC1P11926 461 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 TRPC1P48995 793 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 MAFGO15525 162 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PNKPQ96T60 521 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 GID8Q9NWU2 228 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 DDHD2O94830 711 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 RBP3P10745 1247 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 OOSP2Q86WS3 158 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM162AQ96A26 154 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF263O14978 683 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 PLD3Q8IV08 490 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD28-201ENST00000399451 MDM1Q8TC05 714 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms