RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PSD3Q9NYI0 1048 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 THTPAQ9BU02 230 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A4O43511 780 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CDH16O75309 829 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM253P0C7T8 217 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D4O60343 1298 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 THAP2Q9H0W7 228 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.29■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 ACER1Q8TDN7 264 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 FAM129AQ9BZQ8 928 aa23.29■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A13Q9UJS0 675 aa23.28■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CATSPER1Q8NEC5 780 aa23.28■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 WWOXQ9NZC7 414 aa23.28■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.28■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 TC2NQ8N9U0 490 aa23.28■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTPRM-201ENST00000332175 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 IMPDH2P12268 514 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 RGS2P41220 211 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 KAT2BQ92831 832 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP42Q96MM3 310 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD10Q9H3F6 313 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.27■■□□□ 1.32
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