RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 GATMP50440 423 aa25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ERICH1Q86X53 443 aa25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 BTBD6Q96KE9 485 aa25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ABCB6Q9NP58 842 aa25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ITGB1P05556 798 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TUBB2AQ13885 445 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 NT5DC3Q86UY8 548 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ABI1Q8IZP0 508 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CASD1Q96PB1 797 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 KIF4AO95239 1232 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CALB1P05937 261 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ITGB8P26012 769 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PEX26Q7Z412 305 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PSMB7Q99436 277 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CARD6Q9BX69 1037 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TJP2Q9UDY2 1190 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.23■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ALPK3Q96L96 1907 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PFKMP08237 780 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TTC30AQ86WT1 665 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TNIP3Q96KP6 325 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CPXM1Q96SM3 734 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 OSBPL9Q96SU4 736 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TRIM7Q9C029 511 aa25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ZNF185O15231 689 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ATP2C2O75185 946 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ODC1P11926 461 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CCDC130P13994 396 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PRLRP16471 622 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CAPN2P17655 700 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 DNA2P51530 1060 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 MAMLD1Q13495 774 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 MESDQ14696 234 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PKDCCQ504Y2 493 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ANAPC7Q9UJX3 599 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TIMP1P01033 207 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CXCR5P32302 372 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 RFC2P35250 354 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 LHX1P48742 406 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 PDCLQ13371 301 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 CCDC142Q17RM4 750 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 AMFRQ9UKV5 643 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 ALG6Q9Y672 507 aa25.21■■□□□ 1.63
TMIE-201ENST00000326431 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 M0QZQ0 153 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 GJB6O95452 261 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 PAX3P23760 479 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 TERF1P54274 439 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 NPAS4Q8IUM7 802 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 COG1Q8WTW3 980 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 PARVAQ9NVD7 372 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 SCINQ9Y6U3 715 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 VWA8A3KMH1 1905 aa25.2■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 TCP1P17987 556 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 ADORA2BP29275 332 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 OR1G1P47890 313 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 IKBKEQ14164 716 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 RPS6KA1Q15418 735 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 SUSD3Q96L08 255 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 HESX1Q9UBX0 185 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 KIAA0355O15063 1070 aa25.19■■□□□ 1.62
TMIE-201ENST00000326431 HOXA2O43364 376 aa25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms