RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.28■□□□□ 0.84
USP21-201ENST00000289865 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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USP21-201ENST00000289865 KRT3P12035 628 aa20.28■□□□□ 0.84
USP21-201ENST00000289865 CREB1P16220 341 aa20.28■□□□□ 0.84
USP21-201ENST00000289865 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP21-201ENST00000289865 ARHGAP1Q07960 439 aa20.28■□□□□ 0.84
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USP21-201ENST00000289865 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.28■□□□□ 0.84
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USP21-201ENST00000289865 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.28■□□□□ 0.84
USP21-201ENST00000289865 SYNCQ9H7C4 482 aa20.28■□□□□ 0.84
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USP21-201ENST00000289865 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.27■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 FAM187BQ17R55 369 aa20.27■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.27■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 CYP4X1Q8N118 509 aa20.27■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.27■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.27■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.27■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 DYNLT1P63172 113 aa20.26■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.835e-6■■□□□ 14.3
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USP21-201ENST00000289865 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.26■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 CEP128Q6ZU80 1094 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.25■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 CXorf38Q8TB03 319 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.25■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 ZNF286BP0CG31 522 aa20.25■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 POU5F1BQ06416 359 aa20.25■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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USP21-201ENST00000289865 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP21-201ENST00000289865 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.25■□□□□ 0.83
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